Network
Stx17 merupakan salah satu protein yang berperan dalam fusi autofagosom dengan lisosom Protein ini baru ditambahkan jika autofagosom telah dibentuk. Stx17 memiliki 2 domain utama, yang pertama berupa dua alfa heliks transmembrane, yang menempel satu sama lain dengan glycine zipper dan dihubungkan oleh struktur beta turn . Domain kedua adalah domain sitoplasmik, yang diduga berperan pada proses fusi di atas skema protein tersebut ada pada gambar berikut.
Untuk memastikan fungsi dari Stx17 beserta fungsi setiap domainnya, dilakukan percobaan menggunakan live cell imaging. Metode ini dilakukan dengan me-fusikan protein Stx17 dengan red fluorescence protein, dan melabeli jenis protein lain yaitu VAMP7 yang merupakan penanda untuk lisosom dengan GFP.sehingga apabila terjadi fusi dari autofagosom dan lisosom, akan terjadi kolokasisasi ( perpendara warna di tempat yang sama ) dan terdapat fluoresensi berwarna kuning. Desain percobaan yang dilakukan antara lain: (1) penghilangan domain transmembrane Stx17;(2) penghilangan domain sitoplasmik Stx17; dan (3) Stx17 ditambahkan pada autofagosom yang belum matang. Derajat kolokalisasi diamati untuk melihat efek dari masing masing percobaan seperti pada gamabr berikut:
Tentukan apakah pernyataan berikut benar (B) atau salah (S)!
A. Ketika stx17 dihilangkan domain sitoplasmiknya hanya VAMP7 yang dapat terlokalisasi di autolisosom.
B. Fusi autofagagosom dan lisosom membutuhkan Stx17 yang utuh.
C. Stx17 yang dapat ditambahkan pada autofagosom yang belum matang akan menginhibisi proses fusi dengan lisosom
D. Apabila di perocbaan lain ditemukan bahwa Stx17 dan VAMP7 ternyata ada pada lisosom dan autofagosom sekaligus penghilangan Stx17 di lisosom akan memberikan hasil berupa derajat kolokalisasi yang mirip dengan perlakuan pengilangan domain transmembran.
Baca Juga: CEPAT! Download Video dan Musik YouTube Menggunakan Y2mate Instan dan Tanpa Perlu Instal Aplikasi
Soal 7
Transfer DNA dari organe ke nukleus umum terjadi selama proses evolusi. Akan tetapi masih belum diketahui apakah proses trasfer DNA yang sama dapat terjadi antara organel. Untuk itu dilakukan suatu percobaan menggunakan fragmen restriksi hasilisolasi dari DNA yang sama dapat terjadi antara organel. Untuk itu dilakukan suatu percobaan menggunakan fragmen restriksi hasil isolasi dari DNA kloroplas bayam ( spinach) yang mengandung urutan DNA dari gen Rubisco Gen ini tidak ditemukan di mitokondria bayam. Fragmen restriksi tersebut akan digunakan sebagai probe (pelacak) untuk mendeksi kemungkinan adanya transfer gen antara kloroplas dan mitokondria.
Hanif mengisolasi DNA mitokondria dan kloroplas dari tanaman timun japang ( Zucchini), Jagung (corn), bayam dan kacang (pea) lalu memotongnya dengan enzim restriksi yang sama dan menganalisis hasilnya dengan elkroforesisi gel. Hanif lalu melakukan Souther Blotting menggunakan probe fragmen restriksi bayam di atas. Kehadiran fragmen DNA spesifik di lihat melalui autoradiografi yang hasilnya di tunjukkan pada gambar di bawah ini( m = Mitokondria, c = kloroplas). Perlu diketahui bahwa secara teknis, cukup sulit untuk memperoleh DNA mitokondria yang murni dan tidak terkontaminasi oleh DNA kloroplas ada kemungkinan sempel DNA mitokondria dari satu atau beberapa tanaman di atas telah terkontaminasi.
